目前肝门部胆管癌对外科医生而言仍是一个难题。该病外科治疗的一项进展便是将肝切除术纳入了手术操作。但是，在胆道梗阻造成肝功能障碍的情况下进行肝切除术可能与死亡率上升有关。美国佛罗里达大学肝胆疾病中心的Hemming AW博士及其同事在肝切除术被当作标准治疗的情况下评估了肝门部胆管癌的外科治疗。在1997至2004年间，研究人员回顾了80名接受手术的肝门部胆管癌患者的资料。53名患者接受了治愈性切除术，14名接受了姑息性分流术，其余13名患者的病情则无法接受进一步的治疗。23名患者需要进行门静脉切除重建术来达到阴性切缘，其中3名还需要进行肝动脉重建术。研究结果显示，接受切除术的患者的手术死亡率为9%，发病率为40%。在术前由于肿瘤累及对侧肝叶或门静脉栓塞（PVE）导致肝叶肥大的患者的手术死亡率明显低于那些未出现肥大的患者。接受切除术的患者的中位总体存活期为40个月，5年存活率为35%。80%的患者达到阴性切缘，这与生存状况改善相关。接受切除术且达到阴性切缘的患者的5年存活率为45%。研究人员总结认为，在肝门部胆管癌患者中可联合施行肝脏和胆管切除术，尽管其死亡率高于针对其他适应症施行的肝切除术，但尚能接。
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